KASP™ (Kompetitive Allele Specific PCR)
KASP™ (Kompetitive Allele Specific PCR) เป็นเทคโนโลยี Genotyping ที่เป็นลิขสิทธิ์เฉพาะของบริษัท LGC Biosearch เป็นนวัตกรรมใหม่ที่ถูกพัฒนาขึ้นเพื่อตรวจวิเคราะห์เครื่องหมายทางสารพันธุกรรมชนิด SNPs, InDel โดยหลักการ Fluorescence-based Genotyping assay ซึ่งมีความแม่นยำ ถูกต้อง รวดเร็ว และมีระบบรองรับการตรวจกับจำนวนตัวอย่างที่มีปริมาณมาก
ความพิเศษของเทคโนโลยี KASP อยู่ที่การออกแบบของไพร์เมอร์ ให้มีความจำเพาะต่อ SNPs, InDel หรือตำแหน่ง mutation และ Universal probe ที่ใช้ในการติดตามผล ขั้นตอนการทำประกอบด้วย การสกัดดีเอ็นเอ การทำ PCR และการวิเคราะห์ผลด้วย endpoint Genotyping
ปัจจุบันการตรวจ Allele Specific PCR นั้นได้ถูกนำมาใช้ประโยชน์อย่างมากในการจัดจำแนกชนิดของสิ่งมีชีวิต (genotyping) เช่น การแยกสายพันธุ์ข้าว การตรวจวินิจฉัยโรค เช่นโรคมะเร็ง หรือแม้แต่นำมาใช้ทางด้านเภสัชจลนศาสตร์ (Pharmacokinetics) เพื่อดูการตอบสนองต่อยาที่รักษาคนไข้
* ข้อมูลจาก LGC Biosearch Technologies · Call rate 99.8% ผ่านการทดสอบอิสระกับวิธีสกัดดีเอ็นเอหลายแบบ, template ที่มี GC/AT สูง และพืชหลายชนิด
⚙️ หลักการทำงานของ KASP™
การทำปฏิกิริยาจีโนไทป์ KASP ประกอบด้วยส่วนสำคัญสามส่วน
🧬 DNA Sample
ตัวอย่างดีเอ็นเอที่มีลำดับเบสที่สนใจ
🧪 KASP Assay Mix
ประกอบด้วยไพร์เมอร์ที่จำเพาะต่อเป้าหมาย
⚗️ KASP Master Mix
สารผสมสำหรับปฏิกิริยา PCR และการตรวจวัดสัญญาณฟลูออเรสเซนซ์
✨ ทำไมต้อง KASP™
แม่นยำ (Accurate) : ผ่านการทดสอบอิสระว่าได้ call rate 99.8% กับวิธีสกัดดีเอ็นเอหลายรูปแบบ, template ที่อุดมด้วย GC/AT และพืชหลากหลายชนิด
คุ้มค่า (Cost effective) : ไม่ต้องใช้ไพร์เมอร์หรือโพรบติดฉลากเฉพาะ assay ที่มีราคาสูง ใช้ได้กับดีเอ็นเอที่สกัดแบบหยาบ และใช้ปริมาตรปฏิกิริยาต่ำ
ออกแบบ assay ได้ยืดหยุ่น : ผู้เชี่ยวชาญเลือกชุดไพร์เมอร์ที่ไม่ติดฉลาก 3 ตัวที่เหมาะที่สุดสำหรับ SNP, indel หรือ mega indel ของคุณ
อ่านผลได้หลายแพลตฟอร์ม (Open format) : อ่านสัญญาณได้บน plate reader ที่รองรับ FRET และเครื่อง qPCR ส่วนใหญ่ พร้อมโปรโตคอลทีละขั้นตอนสำหรับเครื่อง qPCR ที่ใช้กันทั่วไป
🎯 KASP™ ได้รับความนิยมอย่างมากในงานต่อไปนี้
การปรับปรุงพันธุ์พืช พันธุ์สัตว์
การตรวจการปนเปื้อน GMO
การตรวจหาการปลอมปนของสายพันธุ์
การอนุรักษ์สายพันธุ์พื้นเมือง
การแปรรูปวัตถุดิบทางการเกษตรด้วยเครื่องหมายโมเลกุล (Biomarker)
การตรวจหายีนกลายพันธุ์ที่ทำให้เกิดโรค
ตัวอย่างความเข้มของสัญญาณฟลูออเรสเซนซ์ที่ติดกับ allele-specific Primers A และ G โดยตัวอย่างจะถูกวิเคราะห์ด้วยการจัดกลุ่ม (Clustering) โดยกลุ่มตัวอย่างในเส้นประสีแดง คือ mutation ของสายพันธุ์ Jonagold และกลุ่มตัวอย่างในเส้นประสีน้ำเงิน คือ Mutation ของสายพันธุ์ Holstein
doi: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0242940.g003
🚀 เริ่มต้นใช้ KASP™ ในห้องแล็บของคุณ
📦 ขอชุดทดลอง
เริ่มจากการประเมินผลด้วย Trial kit (Free trial kit จาก LGC)
🔬 ทดลองในห้องแล็บ
ทดลองใช้งานจริง โดยมีทีมสนับสนุนทางเทคนิคช่วยแนะนำ
🧪 ออกแบบไพร์เมอร์
ติดต่อทีม KASP Assays เพื่อเริ่มออกแบบไพร์เมอร์เฉพาะสำหรับเป้าหมายของคุณ
📚 เอกสารและแหล่งข้อมูล
💬 สนใจ KASP™ Genotyping?
ทีมงาน Lifomics พร้อมให้คำปรึกษาด้านผลิตภัณฑ์และการประยุกต์ใช้งาน
Contact US